Organisateurs et Enseignants

 

Le Dr. Samia Aci-Sèche a rejoint l’équipe Bioinformatique Structurale et Chémoinformatique (SB&C) de l’Institut de Chimie Organique et Analytique (ICOA) de l'Université d'Orléans en novembre 2012. Après un diplôme universitaire en modélisation moléculaire et en chimie théorique à l’université Paris 7, elle s'est spécialisée pendant sa thèse au CBM d'Orléans et ses stages post-doctoraux en bioinformatique structurale et en simulations numériques. Ses recherches portent principalement sur la prédiction des constantes cinétiques des inhibiteurs de protéines kinases par simulations de dynamique moléculaire.

 

 

 

Le Dr. Florent Barbault est maitre de conférences à l’université de Paris. Après 2 années de recherche dans l’industrie pharmaceutique en Alsace, il rejoint le laboratoire Interfaces Traitements Organisation et DYnamique des Systèmes (ITODYS, UMR 7086) en 2003 et travaille principalement sur l’étude fine des interactions entre un ligand et une macromolécule en mettant l’accent sur les simulations hybrides (QM/MM) et les simulations hétérogènes. Actuellement, un de ses brevets sur l’inhibition d’une kinase est en cours de valorisation par un laboratoire pharmaceutique.

 

 

 

Le Pr. Pascal Bonnet a intégré la recherche académique en septembre 2012 après 10 années effectuées dans le secteur privé en recherche pharmaceutique. Directeur de l’Institut de Chimie Organique et Analytique (ICOA) de l'Université d'Orléans depuis 2016, il dirige aussi l'équipe de Bioinformatique Structurale et Chémoinformatique (SB&C). L’équipe SB&C de l’ICOA développe et utilise des méthodes in silico appliquées à la compréhension des systèmes moléculaires et aux interactions biomoléculaires dans le domaine de l’innovation thérapeutique, la cosmétique et la chimie analytique.Il utilise les outils de chémoinformatique, machine learning, criblage virtuel, chimie quantique et dynamique moléculaire.

 

 

 

Le Dr. Patrick Fuchs est maître de conférences à l'Université de Paris. Il effectue ses activités de recherche dans le Laboratoire de BioMolécules (UMR 7203, Sorbonne Université). Il est le président du Comité Thématique 7 (CT7 - Systèmes moléculaires organisés et Biologie) du GENCI (Grand Equipement National de Calcul Intensif) pour l'attribution de ressources dans les centres nationaux de calcul scientifique (CINES, IDRIS, TGCC). Il est spécialisé en modélisation moléculaire des interactions protéines et peptides / membranes. Il s'intéresse particulièrement aux hélices amphipathiques et à leur sélectivité pour certaines compositions lipidiques. Il utilise principalement les simulations de dynamique moléculaire tout-atome ainsi que les techniques d'échantillonnage augmenté comme le replica-exchange.

 

 

 

Matthieu Montès est Professeur en bioinformatique au CNAM, il y dirige l’équipe de modélisation moléculaire et de drug design du laboratoire Génomique, Bioinformatique et Chimie Moléculaire. Son expertise porte sur le drug discovery and design, la géometrie computationnelle, la visualisation et la simulation haut débit ou interactive. Il est co-auteur de 47 publications dans des journaux internationaux à comité de lecture, co-inventeur de 7 brevets sur des molécules à visée thérapeutique dans les domaines du cancer et des maladies inflammatoires chroniques dont certains sont concédés en licence à des entreprises pharmaceutiques.

 

 

 

Le Dr Gautier Moroy est maitre de conférences à l'Université de Paris. Il effectue ses activités d'enseignement, liées à la bioinformatique structurale, principalement dans le parcours "in silico drug design" et dans le parcours "Biologie-Informatique" du master de BioInformatique de l'Université de Paris. Il réalise ses activités de recherche au sein de l'équipe Computational Modeling of Protein-Ligand Interactions (CMPLI, Inserm ERL U1133) de l'unité Biologie Fonctionnelle et Adaptative (BFA, CNRS UMR 8251) où il étudie essentiellement les mécanismes moléculaires à l'origine des interactions entre des protéines d'intérêt thérapeutique et des ligands potentiellement inhibiteurs (petites molécules ou peptides) par des approches de bioinformatique structurale et de modélisation moléculaire (docking, criblage virtuel, simulations de dynamique moléculaire ...).

 

 

 

Le Dr. Antoine Taly est chercheur CNRS au laboratoire de Biochimie Théorique (LBT, CNRS UPR9080) de l'Institut de Biologie Physico-Chimique (IBPC). Il est spécialisé dans l'étude des récepteurs, des neurotransmetteurs, leur role dans les pathologies (Alzheimer, Douleur, Epilepsie, etc...) et leurs interactions avec leurs ligands (Glutamate, Serotonine... mais aussi Nicotine, Prozac...).